Charic Daniel Farinango Cuervo y David Santiago García Chicangana hacen parte del proyecto ganador denominado Doctor Disease. El proyecto participó junto a otros 250 equipos con propuestas de distintas áreas, durante el evento desarrollado por Correlation One, y del cual la Universidad del Cauca es aliado académico con el apoyo del Ministerio de Tecnologías de la Información MinTIC.
Charic Daniel Farinango Cuervo, egresado de Ingeniería Electrónica y David Santiago García Chicangana de Ingeniería de Sistemas, hacen parte del equipo ganador de la gran final de Science for All DS4A. El proyecto ganador fue Doctor Disease, una solución basada en machine learning para la predicción de diagnósticos de sífilis y diabetes a partir de la información clínica de los pacientes y de sus notas médicas, el cual, fue propuesto por la multinacional IQVIA a MinTIC.
El desarrollo del proyecto implicó uso de tecnologías de procesamiento de Lenguaje Natural (NLP) para extraer información relevante de las notas médicas electrónicas y, posteriormente, ser utilizada en la creación del modelo que permite predecir el diagnóstico de un paciente entre las dos enfermedades mencionadas (3 tipos de diabetes y 6 tipos de sífilis).
Para ello, la empresa suministró tres conjuntos de datos, los cuales, fueron analizados, limpiados y procesados para su posterior uso. Entre más de 180 mil variables para analizar, se seleccionaron las más relevantes. Además, se entrenaron más de 300 modelos con distintas combinaciones de hiper paramétricos y clasificadores, tanto de deep learning como de machine learning tradicional. Teniendo en cuenta la complejidad del problema propuesto, el tiempo de entrenamiento y predicción y su desempeño bajo la métrica de F1, el clasificador elegido fue XGBoost. Este presentó un 88% de exactitud con algunas variaciones entre las subclases”, indicó el egresado Charic Daniel Farinango.
Aunque el reto propuesto por la empresa estaba enfocado en el modelo de datos, el equipo decidió hacer más. Por lo anterior, crearon una aplicación web que contiene un dashboard interactivo para que el personal interesado pueda consultar la situación de la población atendida, y las características de sus pacientes. Adicionalmente, se dispuso de una sección para la predicción de diagnósticos de pacientes, el cual, podrá apoyar al personal médico en el proceso de toma de decisiones.
En un futuro se esperaría que la herramienta se pueda extender a más diagnósticos y métodos de clasificación más avanzados. Los desarrolladores del proyecto creen que, esta solución puede ser de gran impacto social como apoyo a los profesionales en salud. Se espera que pueda prestar ayuda de alertas tempranas, extender el alcance de servicios de salud a comunidades de difícil acceso y agilizar la remisión de exámenes y tratamientos médicos más exhaustivos a pacientes.
El equipo fue conformado por:
- Jorge Alfredo Acevedo Ramos – Electronic and Industrial Engineer – desde Santa Marta.
- Charic Daniel Farinango Cuervo – Computer Scientist, Software Developer and AI Enthusiast – desde Popayán.
- Juan Manuel Gómez González – Biomedical Engineer, Software Developer, and Data Scientist desde Waterloo, CA.
- David Santiago García Chicangana – Systems Engineer, Web Developer and Assistant Professor – desde Popayán.
- Daniel Montes Agudelo – Software Developer – desde Manizales.
- Cristian Eduardo Prieto Triana – Systems Engineer – desde Bucaramanga.
- Gerson Steven Ruiz Lozano – Economist, Supply Chain Data Analyst – desde Cali.
Durante el curso participaron 250 equipos con proyectos de distintas áreas. Para el día de la graduación, fueron elegidos 5 finalistas. Luego el día de la final, un jurado de diferentes áreas y experiencias en analítica de datos, realizaron preguntas y escogieron al equipo ganador.
“Con esto se cierra un proceso a lo largo de todas las cohortes de este programa, la alianza con el MinTIC y la empresa Correlation One, que logró la formación de más de 3.800 nuevos científicos de datos a nivel nacional, entre los que hay 140 profesores universitarios como potenciales replicadores y se desarrollaron más de 175 proyectos y retos en la temática”, indicó el profesor Gustavo Ramírez coordinador de la acción de formación desde la Universidad del Cauca.
Charic Daniel Farinango Cuervo es egresado del programa de Ingeniería en Electrónica y Telecomunicaciones de la Universidad del Cauca con énfasis en Telemática. Fue beneficiario de la beca Fulbright en 2019, para estudios de Maestría en Ciencias de la Computación en la Universidad de Illinois en Chicago, USA. Dentro de sus intereses se encuentran la visión computarizada y el procesamiento de lenguaje natural.
David Santiago García Chicangana es egresado del programa de Ingeniería de Sistemas de la Universidad del Cauca, joven Investigador Colciencias 2019-2020, y, actualmente, se desempeña como profesor catedrático de la misma Universidad. Dentro de sus intereses se encuentran machine learning, ciencia de datos, desarrollo web y móvil, entre otros.